基因表达与调控

基因表达研究通过比较分析两组或两组以上不同来源的mRNA转录丰度的差异,通过计算杂交信号的比值和统计分析,获得差异表达基因的信息,为研究基因功能和基因遗传调控网络提供有力手段。表达谱芯片(或称基因芯片)可用来进行分子标记、新药研发、临床诊断、毒理、药理及育种等领域的研究。

源宜基因为用户提供基于Affymetrix芯片平台的表达谱芯片检测服务,为客户提供从实验设计到数据分析一整套流程服务;我们还可以提供定制表达谱芯片服务。

全转录组基因表达芯片

GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0

最高分辨率的基因表达芯片,支持所有转录本异构体的全转录组分析

GeneChip®Human Transcriptome Array 2.0芯片包含了超过六百万条不同探针,覆盖编码和非编码转录本。该芯片上70%的探针覆盖编码转录本的外显子,其余30%的探针覆盖外显子之间的剪接位点和非编码转录本。它无以伦比的覆盖度带来了迄今为止最为深入的编码和非编码转录本研究。支持FFPE样本(福尔马林固定石蜡包埋)和新鲜冻存样本。

GeneChip®Mouse / Rat Transcriptome Assay 1.0

大小鼠转录组分析-一次实验 ,多个生物学层面分析

大小鼠模型已被证明是研究生物分子相互作用和人类疾病的一种宝贵工具。大小鼠基因组与人类基因组有类似之处,通过用一个改变的或失活的版本代替基因或使基因灭活,可方便地操纵大小鼠基因以模仿人类疾病状态。此款芯片是快速、简便、经济地分析大小鼠转录组的表达变化的最强大最灵活的工具。支持新鲜组织和新鲜冰冻组织、血液以及FFPE 样本。

GeneChip®Mouse Gene 2.0 芯片

该芯片可以同时检测小鼠的mRNA和lincRNA(long intergenic non-coding RNA),并通过Affymetrix® Transcriptome Analysis Console(TAC)软件进行基因水平、外显子水平及可变剪切分析。

GeneChip® Rat Gene 2.0 芯片

此款芯片是全转录组基因表达芯片,配合Affymetrix® Transcriptome Analysis Console(TAC)软件可对大鼠进行基因水平、外显子水平及可变剪切分析。

3’IVT基因表达芯片

Almac Xcel™ FFPE 样本表达谱芯片

Almac Xcel™ 芯片是目前市场上唯一一款为福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本设计和优化的3'端表达谱芯片。芯片可从分离自FFPE组织的RNA中产生可靠的数据,可检测超过97,000多个转录本,从而促进了临床样本中生物标志物的开发、验证和商业化。

GeneChip®Human Genome U133 Plus 2.0 芯片

此款芯片为第一张人类全基因组表达综合分析芯片,是3’IVT基因表达芯片的黄金标准。

GeneChip® PrimeView™ 人类基因表达谱芯片

PrimeView™ 人类基因表达谱芯片以卡式芯片(Cartridge)形式提供了高质量的基因表达分析技术,实现了全基因组的基因表达分析。PrimeView™ 芯片表现出极高的性能,检测信号强以及重复样品的倍数变化关联性好;它是一款研究药物和疾病调控机制的强大且经济高效的工具。

miRNA芯片

GeneChip®miRNA 4.0芯片

全方位了解编码及非编码转录本调控

许多疾病,包括癌症,往往可以被看做是由基因表达错乱所引起的。据估计,30%以上的编码基因翻译成蛋白质都是由miRNA调控。研究表明,miRNA与信号网络中调控可变剪切事件的长链非编码RNA(long non-coding RNA)相互作用,从而影响了凋亡、增殖和分化等细胞过程—所有这一切都能可成为各种疾病(比如癌症)的致病因素。检测这些关键调控节点的变化对于研究差异表达基因的生物学背景极为重要。miRNA 4.0芯片是一个强大的工具,有助于研究非编码RNA的作用及其在发育和生理机制中的参与程度。

基因表达调控

GeneChip® Human Promoter 1.0R芯片

此款芯片为染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation, ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(Methylated DNA Immunoprecipitation, MeDIP)实验设计,该芯片设计超过460万探针,覆盖人类基因25,500个启动子区域。

样品要求

需要的DNA量为1ug(在实验前,要对DNA进行质检,另外考虑到实验室间浓度定量的差异,在客户送样时,要求总量大于2ug),浓度大于50ng/ul,260/280>1.6,260/230>1.6。

定制芯片

源宜基因可以提供各种动植物及微生物的基因表达和基因分型芯片设计,可用于全转录组基因表达分析、外显子水平分析、转录本作图、SNP发现、3’端基因表达分析、再测序和全基因组基因分型等。